Le Cerneux-Péquignot liegt an der Grenze zu Frankreich auf etwa 1100 Metern Höhe und hat ca. 300 Einwohner. Die Postleitzahl der Gemeinde ist die 2414 und die Telefon-Vorwahl lautet 032. Le Cerneux-Péquignot hat das Autokennzeichen/Kontrollschild NE. Nachbarorte von Le Cerneux-Péquignot sind La Chaux-du-Milieu (Entfernung ca. 3,7 km), Villers-le-Lac (Frankreich, Entfernung ca. 6 km), Les Ponts-de-Martel (Entfernung ca. 6 km), La Brévine (Entfernung ca. 7 km), Les Brenets (Entfernung ca. 8 km) und Brot-Plamboz (Entfernung ca. 9 km).