Märstetten liegt im Thurgauer Bezirk Weinfelden. Die Postleitzahl der Gemeinde ist die 8560 und die Telefon-Vorwahl lautet 071. Märstetten hat das Autokennzeichen/Kontrollschild TG. Zur Gemeinde Märstetten gehört unter anderem auch der Ortsteil Ottoberg. In Märstetten und seinen Ortsteilen leben zusammen ungefähr 2.600 Einwohner.
Nachbargemeinden von Märstetten sind unter anderem Wigoltingen (ca. 3,4 Kilometer entfernt), Amlikon-Bissegg (ca. 3,8 Kilometer entfernt), Wäldi (ca. 3,9 Kilometer entfernt), Bussnang (ca. 5 Kilometer entfernt), Weinfelden (ca. 5 Kilometer entfernt) und Raperswilen (ca. 6 Kilometer entfernt).